Sim. Ao contrário da Nota de Débito (que parte de uma nota de saída), a Nota de Crédito parte de uma nota que está no fluxo de Suprimentos / Entrada de Nota Fiscal do Base ERP. A nota deve ter sido criada por um destes caminhos:
Digitação manual
Importação do XML
Manifestação do destinatário (download direto do DF-e)